供受者之间ABO血型不合的造血干细胞移植后血型转换的时间为60～120天，因移植类型不同而异：其中HLA相合同胞骨髓移植后供受者之间ABO血型大不合、小不合、双向不合（既有大不合又有小不合）的血型转换时间分别为128天、113天和112天；无关供者骨髓移植后供受者之间ABO血型大不合、小不合、双向不合（既有大不合又有小不合）的血型转换时间分别为65天、114天和26天；外周血造血干细胞移植后供受者之间ABO血型大不合、小不合、双向不合（既有大不合又有小不合）的血型转换时间分别为70天、70天和63天。这说明外周血造血干细胞移植后血型转化快于骨髓移植。

在ABO血型不合的异基因造血干细胞移植过程中，输血也要区别对待。对于血型小不合，移植后可选用与供者血型一致或O型血红细胞及与受者血型一致的血小板直至血型转为供者血型。ABO血型大不合可选择与受者血型一致的红细胞或输注供者血型一致的血小板（应确保血小板内不含有红细胞）直至血型转为供者型。对于混合ABO血型不合，可输O型红细胞、AB型血小板。